Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GRIK2Q13002 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms