Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EP300Q09472 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EP300Q09472 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms