Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms