Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms