Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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