Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms