Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms