Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACADSBP45954 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms