Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms