Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms