Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms