Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms