Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms