Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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