Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CEP44Q9C0F1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms