Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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