Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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