Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC16Q8NEE8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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