Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDDC3Q8N4P3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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