Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA9Q16790 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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