Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.6 ms