Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CNGA3Q16281 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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CNGA3Q16281 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNGA3Q16281 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CNGA3Q16281 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CNGA3Q16281 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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