Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms