Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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