Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREMQ03060 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms