Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms