Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms