Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms