Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms