Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA1P17302 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA1P17302 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms