Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms