Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC175P0C221 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC175P0C221 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms