Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CYTIPO60759 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms