Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DENRO43583 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DENRO43583 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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