Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TO15178 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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