Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms