Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms