Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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