Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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