Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF11Q15544 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms