Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.5 ms