Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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