Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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