Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF5Q13243 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms