Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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