Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms