Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP7AQ04656 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms