Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms