Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms