Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms